기업들의 자회사 상장 흐름이 지속되면서 중복상장에 대한 경계심이 확대되고 있다. 이른바 ‘쪼개기 상장’으로 인해 지주사 가치 훼손 우려가 부각되자 모회사들의 주가도 하락세를 면치 못하는 상황이다.

12일 한국거래소에 따르면 전날 GC지놈은 공모가(1만500원) 대비 5.71% 오른 1만1100원에 코스닥 시장에 상장했다. 상장 첫날 소폭 상승했지만, 장중 40% 이상 급등했던 것을 감안하면 기대에 못 미친 성과로 보여진다. GC지놈은 상장 전부터 중복 상장 논란에 휩싸였던 만큼, 시장의 반응도 저조했던 것으로 보여진다. 지난달부터 현재까지 국내 증시에 상장한 11개(스팩 등 제외) 기업들의 상장 당일 주가 상승률 평균은 약 85% 수준이다.

같은 날 GC지놈의 모회사인 GC녹십자 주가는 0.22% 소폭 하락세를 보였다. 코스피가 1.23% 상승함과 동시에 녹십자 계열사 대부분이 오름세를 보인 것과 대조적이다.

녹십자는 그룹 계열사 중 7개사를 상장시키면서 중복 상장 논란이 불거졌었다. 앞서 녹십자홀딩스, 녹십자웰빙, 녹십자엠에스, 지씨셀, 유비케어 등이 상장돼 있었고 마지막으로 GC지놈이 11일 코스닥 시장에 입성했다. 특히 GC지놈의 지분 구조상 녹십자가 23.37%, 녹십자홀딩스 11.5%, 지씨셀 0.12%, 녹십자엠에스 0.09% 등 계열사들이 크게 보유하고 있다는 점이 주목된다. 자회사 상장을 통해 그룹 전체가 자금 조달이나 지분가치 상승의 이익을 누리는 반면, 모회사 주가의 가치 하락은 주주들이 떠안을 가능성이 높기 때문이다.

실제로 녹십자의 주가는 올해 들어 전날까지 24.57% 하락했다. 지주사들이 새 정부의 상법개정안 수혜주로 분류되면서 녹십자도 7거래일 연속 상승세를 보였지만, 여전히 주가는 저점에 머물러 있는 모습이다.

김한이 현대차증권 연구원은 "국내 지주회사는 구조적으로 자회사들과 중복 상장이 태생적 요인을 갖고 있다"면서도 "중복상장으로 인해 지주사의 성장 기대 줄어들며 순자산가치(NAV) 할인율이 점진적으로 확대되고 있다"고 설명했다. 주가 흐름상 과거에는 상장 지분 가치 적정할인율이 통상 30%였지만 40%, 50%, 60%까지 높아지는 경향을 보였다는 부연이다.

이에 대해 GC지놈 측은 "모회사인 녹십자와 GC지놈은 사업부가 겹치지 않을 뿐더러, 상장으로 조달한 자금을 암종 확대와 암 전주기 진단 기술 개발, 글로벌 시장 다변화에 투자할 계획"이라고 설명했다.

하지만 GC지놈의 성장성도 물음표다. 에프앤가이드에 따르면 GC지놈은 2022년부터 2024년까지 영업이익, 당기순이익 모두 적자 흐름을 보이고 있다. 영업이익의 경우, 2023년 2억원의 흑자를 기록했지만 이후 지난해 다시 12억원의 영업손실로 반전되며 적자전환했다.

게다가 내부거래 비중이 높다는 지적도 받고 있다. GC지놈의 내부거래 비중은 적자를 지속했던 2023년과 2024년에도 각각 81.8%, 85.6%를 유지했던 것으로 나타났다. 사실상 계열사 의존도가 높은 상황에서 상장에 나선 것이다.

분할 상장으로 인한 모회사 할인은 국내 증시에서 더러 발견되는 문제로 꼽힌다. 앞서 카카오, LG화학, SK케미칼 등도 핵심 자회사를 상장시킨 뒤 주가가 반토막 났다는 지적을 받고 있다. 전날 종가 기준으로 각각 자회사를 상장시킨 뒤 ▲SK케미칼 79.83% ▲카카오 65.50%(카카오뱅크 상장 기준) ▲LG화학 68.60%씩 떨어져 있는 상태다.

다만 이재명 대통령이 취임 후 2∼3주 안에 상법 개정안을 보완 처리하겠다고 밝히면서 분할·중복 상장에 대한 규제도 엄격해질 것으로 예상된다. 이나예 한국투자증권 연구원은 "이사회의 의사결정에 대한 감시와 견제가 강화될 것이란 측면에서 상법 개정은 한국 증시 재평가에 긍정적으로 작용할 것"이라고 내다봤다.

이 연구원은 "그동안 이사회 의결 시 모든 주주의 이익을 고려하기보다 지배력을 행사 중인 지배주주의 이익을 우선해 왔으며, 그 결과 대기업 집단 중심의 경제력 집중 현상은 더욱 심화했다"며 "한국 증시 디스카운트의 배경으로 꼽히는 모자 회사의 중복 상장, 무분별한 자사주 처분, 대규모 내부거래 등이 이에 해당한다"고 설명했다.